In der Geschichte von Puzzle Bobble Everybubble! verschlägt es Bub, Bob, Peb und Pab auf die Regenbogeninseln, wo Miniroon, eine geheimnisvolle Figur, die Bub ähnelt, lebt. Eines Tages fängt Miniroon plötzlich an, Seifenblasen zu pusten, die die ganze Insel bedecken und den Inselbewohnern grosse Probleme bereiten.