Als je net lekker aan het ontspannen bent, gaat plotseling de pizzakoerier in ninja-uitrusting aan de deur. De 17-jarige Kurou is een van de 20.000 ninja's die als "slapers" op opdrachten wachten. Geregistreerd bij een bureau dat na de Tweede Wereldoorlog is opgericht om de Stille Oceaan te beschermen tegen terrorisme en geweld, moet hij het opnemen tegen buitenlandse huurmoordenaars. De eerste inzetlocatie is toevallig een school – voor Kurou, die een NEET is, de absolute nachtmerrie.