De spin-off vertelt het verhaal van de laatste Naruto-film - Boruto - Naruto the Movie (zomer 2015) en zet dit voort. De manga is geschreven door Ukyo Kodachi (auteur) en getekend door Mikio Ikemoto, onder toezicht van de Naruto-mastermind Masashi Kishimoto, en verschijnt maandelijks. Naruto Uzumaki is eindelijk Hokage en trotse vader van twee kinderen. Zijn zoon Boruto wordt beschouwd als een wonderkind en is net zo rebels als zijn vader ooit was. Boruto is geïrriteerd door zijn vader, die blijkbaar niets anders kent dan zijn werk. Hij besluit te rebelleren tegen de verouderde denkwijze van de ninja's en vraagt Sasuke om hem te trainen, zodat hij een betere ninja kan worden dan Naruto.